Ilmuwan Telusuri Gen Virus Corona yang Tahun Lalu Diam-diam Dihapus di Wuhan

JAKARTA - Seorang ilmuwan berupaya memulihkan urutan gen virus corona yang tahun lalu dihapus secara diam-diam di Wuhan, China. Hasil penelusuran ini akan memberi gambaran tentang asal usul SARS-CoV-2 dari Wuhan tanpa perlu studi lapangan karena dipersulit oleh pemerintah setempat.

Dilansir Live Science, menemukan asal-usul SARS-CoV-2 (virus corona) yang bertanggung jawab atas kematian 3,9 juta orang di dunia, sebagian besar terhambat oleh kurangnya akses ke informasi dari China tempat kasus pertama kali muncul di Wuhan.



Jesse Bloom dari Howard Hughes Medical Institute di Seattle telah mencari file yang dihapus dan mengungkapkan 13 urutan genetik parsial untuk beberapa kasus awal COVID-19 di Wuhan.

Untuk menentukan dengan tepat bagaimana dan dari mana virus itu berasal , para ilmuwan perlu menemukan apa yang disebut virus progenitor, yang darinya semua strain lain diturunkan.

Hingga saat ini, urutan paling awal terutama adalah sampel dari kasus di Pasar Makanan Laut Huanan di Wuhan, yang awalnya dianggap sebagai tempat pertama kali virus corona muncul pada akhir Desember 2019.

Namun, kasus dari awal Desember 2019 tidak memiliki hubungan dengan pasar Huanan. Ini menunjukkan di awal pandemi bahwa virus muncul dari tempat lain.



Ada satu masalah yang mengganggu dengan urutan genetik pertama itu. Kasus-kasus dari kasus yang ditemukan di pasar termasuk tiga mutasi yang hilang dalam sampel virus.

"Mereka tiga langkah lebih mirip dengan virus corona kelelawar daripada virus dari pasar ikan Huanan," kata Bloom kepada The New York Times.

"Data baru ini mengisyaratkan bahwa virus itu beredar di Wuhan jauh sebelum muncul di pasar makanan laut," kata Bloom.

"Fakta ini menunjukkan bahwa urutan pasar, yang merupakan fokus utama epidemiologi genom dalam laporan bersama WHO-China tidak mewakili virus yang beredar di Wuhan pada akhir Desember 2019 dan awal Januari 2020," tulis Bloom dalam makalahnya yang diunggah 22 Juni ke database pracetak bioRxiv.

Menurut Zimmer, sekitar setahun yang lalu 241 urutan genetik dari pasien virus corona telah hilang dari database online bernama Sequence Read Archive yang dikelola oleh National Institutes of Health (NIH).



Bloom memperhatikan urutan yang hilang ketika dia menemukan spreadsheet dalam sebuah penelitian yang diterbitkan pada Mei 2020 di jurnal PeerJ di mana penulis mencantumkan 241 urutan genetik SARS-CoV-2 hingga akhir Maret 2020; urutannya adalah bagian dari proyek Universitas Wuhan yang disebut PRJNA612766 dan diduga diunggah ke Arsip Baca Urutan.

Dia mencari database arsip untuk urutan dan mendapat pesan "Tidak ada item yang ditemukan," tulis Bloom di makalah bioRxiv, yang belum ditinjau oleh rekan sejawat.

Penyelidikannya mengungkapkan bahwa urutan yang dihapus telah dikumpulkan oleh Aisu Fu dan Rumah Sakit Renmin Universitas Wuhan. Pracetak penelitian yang diterbitkan dari urutan tersebut menunjukkan bahwa mereka berasal dari sampel usap hidung dari pasien rawat jalan dengan suspek COVID-19 di awal epidemi.

Bloom tidak dapat menemukan penjelasan mengapa urutan gen virus corona dihapus. Emailnya ke kedua penulis terkait untuk menanyakan tidak mendapat tanggapan.



Bloom mencatat beberapa keterbatasan pada penelitiannya, terutama bahwa urutannya hanya sebagian dan tidak menyertakan informasi tanggal atau tempat pengumpulan sampelnya.

Terlepas dari itu, Bloom berpikir bahwa melihat lebih dalam pada data yang diarsipkan dari NIH dan organisasi lain dan menyatukan urutannya dapat membantu memberikan gambaran yang lebih jelas tentang asal dan penyebaran awal SARS-CoV-2 tanpa perlu melakukan studi lapangan di China.